تأسس قسم هندسة البرمجيات في جامعة عجلون الوطنية عام 2015،و يعد من التخصصات الحديثة في العصر الذي نعيشه عصر البرمجيات والتكنولوجيا، التي تُدرج ضمن قائمة الـ IT، حيث أنَّه مبنيا على مجموعة من القواعد والأسس التي تهدف وتغدو نحو تصميم، وتطوير برمجيات، وبرامج ذات جودة عالية ان تخصص هندسة البرمجيات من أهم التخصصات الجديدة التي ظهرت على الساحة العلمية وفقاً لشدة الحاجة إليها ، إذ يقوم المتخصصون بهندسة البرمجيات بالعديد من الأعمال الضرورية لضمان تطوير النظم البرمجية وبنائها، اعتماداً على منهجيات هندسة البرمجيات ومعايير قياسية معتمدة، والهدف من ذلك، التحقق من حسن أدائها وسلامتها من الأخطاء، ويهتم التخصص ببناء التطبيقات البرمجية وصيانتها، باستخدام الأساليب والأدوات التقنية الحديثة لبناء البرامج، ويجمع مهندس البرمجيات لذلك بين المعارف العلمية والمهارات العملية، تشمل علوم الحاسوب ونظم المعلومات وإدارة المشاريع والعلوم الهندسية، إضافة إلى المعرفة بالحقل التطبيقي للبرنامج.
التميز والرّيادة في تقديم البرامج والمناهج التعليميّة والبحثيّة في هندسة البرمجيّات لخدمة المجتمع على المستوى المحلي والاقليمي والدولي.
إعداد مختصين في بناء بيئة البرمجيّات وتصميمها وتطويرها وفحصها وتوثيقها وفق منهجيّات معياريّة وأدوات حديثة من خلال توفير بيئة علمية وبحثية وأكاديمية تطبيقية متميزة رائدة ومحفّزة للإبداع والتميّز ومشاريع بحثيّة تطبيقية تلبي حاجة سوق العمل المحلّي والدولي.